Вадим, день добрый.

Вполне возможно, что по лайн-ауту аппарат выдает в режиме директ, без какой-либо дополнительной обработки. А с выхода на наушники у Вас может быть активирован какой-либо из режимов эквалайзера, если он там есть. Если таковые настройки есть в плеере - установите нейтральный режим и сравните. По идее должен быть одинаковый звук.
Если все же слушать с выхода на наушники - то настоятельно рекомендуется громкость на плеере выводить ближе к максимуму, чтобы на усилителе не выкручивать ручку громкости к максимуму - так можно попалить пищалки, ибо усилитель работающий в пике - сам начинает давать искажения. По феншую, на усилителе вообще не рекомендуется выкручивать ручку громкости выше половины. если таковое приходится делать - усилитель по мощности не соответствует акустике.