Вероятнее всего, была допущена какая-то ошибка при настройке параметров записи. Для эксперимента попробуйте функцию копирования Audio-CD этой же программой на любой из своих дисков (настройки при этом установите на умолчанные). Если копия будет прекрасно воспроизводиться (в т.ч. и первый трек), значит, проблема в настройках 100%. Точнее дистанционно сложно что-то посоветовать. Попробуйте вернуть настройки на установленные по умолчанию.