В Вашем случае звук будет примерно одинаков, что касательно компакт дисков, но если организовывать систему с звуковой картой, нужно иметь ПК с приводом, звуковую карту, программный плеер и соответствующий кодек ASIO. Что может быть не очень удобно. Проигрыватель более автономен. Но звуковая карта к примеру может воспроизводить больше форматов HD audio.

Если сравнивать с хорошим СD-плеером HI-FI уровня, типа Rotel RCD-1572 MKII, то конечно же связка с картой и недорогим проигрывателем CD, разница в качестве звучания будет и она будет слышна. За счет правильного питания цепей проигрывателя и высококачественного выходного аналогового выходного каскада и более высококачественного привода. Но эта реализация имеет смысл,если весь звуковой тракт будет аналогичного класса ( усилитель, кабель, акустика).